Bioconductor版本:版本(3.17)
通过R位深蓝表观遗传学数据服务器访问。
作者:费利佩·阿尔布雷特,马库斯列表
维护人员:菲利普阿尔布雷特<费利佩。albrecht mpi-inf.mpg.de >, <马库斯·马库斯列表。列表在tum.de >,佼佼者Quirin Manz < Quirin。在tum.de manz >
从内部引用(R,回车引用(“位深蓝”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“位深蓝”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“位深蓝”)
HTML | R脚本 | 位深蓝外遗传性数据服务器- R包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,CpGIsland,DNAMethylation,DataImport,DataRepresentation,表观遗传学,GeneRegulation,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,预处理,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (> = 3.3), XML, RCurl |
进口 | GenomicRanges、数据。表、stringr diffr dplyr,方法,rjson,跑龙套,R。跑龙套、foreach withr,rtracklayer,GenomeInfoDb设置,filehash |
链接 | |
建议 | knitr rmarkdown,萝拉,Gviz,ggplot2 gplots tidyr、RColorBrewer matrixStats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | DeepBlueR_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | DeepBlueR_1.26.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | DeepBlueR_1.26.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | DeepBlueR_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeepBlueR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/位深蓝 |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DeepBlueR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DeepBlueR/ |
包下载报告 | 下载数据 |