DExMA

DOI:10.18129 / B9.bioc.DExMA

差异表达元分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

考虑缺失基因的可能存在,执行基因表达元分析的所有步骤。它提供了必要的功能,能够执行不同的基因表达元分析方法。此外,它还包含应用质量控制、下载GEO数据集和显示结果图形表示的功能。

作者:胡安·安东尼奥Villatoro-García [aut, cre],佩德罗Carmona-Sáez [aut]

维护者:Juan Antonio Villatoro-García

引文(从R内,输入引用(“DExMA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DExMA”)

PDF R脚本 用DExMA包进行差异表达元分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression质量控制软件StatisticalMethod
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 4.1),DExMAdata
进口 BiobaseGEOquery嫁祸于limmapheatmapplyr尺度snpStats股东价值分析沼泽,统计,方法,utils,bnstructRColorBrewer, grDevices
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建议 BiocStyleqpdfBiocGenericsRUnit
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 DExMA_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 DExMA_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) DExMA_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) DExMA_1.5.5.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DExMA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DExMA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DExMA/
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