Bioconductor版本:发行版(3.16)
考虑缺失基因的可能存在,执行基因表达元分析的所有步骤。它提供了必要的功能,能够执行不同的基因表达元分析方法。此外,它还包含应用质量控制、下载GEO数据集和显示结果图形表示的功能。
作者:胡安·安东尼奥Villatoro-García [aut, cre],佩德罗Carmona-Sáez [aut]
维护者:Juan Antonio Villatoro-García
引文(从R内,输入引用(“DExMA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DExMA”)
R脚本 | 用DExMA包进行差异表达元分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,质量控制,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 4.1),DExMAdata |
进口 | Biobase,GEOquery,嫁祸于,limma,pheatmap,plyr,尺度,snpStats,股东价值分析,沼泽,统计,方法,utils,bnstruct,RColorBrewer, grDevices |
链接 | |
建议 | BiocStyle,qpdf,BiocGenerics,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DExMA_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | DExMA_1.6.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | DExMA_1.6.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | DExMA_1.5.5.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DExMA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DExMA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DExMA/ |
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