DEScan2

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEScan2

微分浓缩扫描2

Bioconductor版本:版本(3.17)

集成的峰值和微分调用者,专门为广泛的外遗传性的信号。

作者:达里奥Righelli (aut (cre),约翰Koberstein (aut),布鲁斯·戈梅斯(aut),南希·张(aut),克劳迪娅Angelini (aut),露西娅Peixoto (aut),大卫。Risso (aut)

维护人员:达里奥Righelli <达里奥。在gmail.com righelli >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DEScan2”)

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文档

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HTML	R脚本	DEScan2装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,表观遗传学,ImmunoOncology,PeakDetection,测序,软件
版本	1.20.1
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges
进口	BiocParallel,BiocGenerics,ChIPpeakAnnodata.table,DelayedArray,GenomeInfoDb,GenomicAlignments、胶水、IRanges、plyr Rcpp (> = 0.12.13),rtracklayer,S4Vectors(> = 0.23.19),SummarizedExperiment、工具、跑龙套
链接	Rcpp, RcppArmadillo
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat,刨边机,limma,EDASeq,RUVSeq、RColorBrewer statmod
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DEScan2_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	DEScan2_1.20.1.zip
macOS二进制(x86_64)	DEScan2_1.20.1.tgz
macOS二进制(arm64)	DEScan2_1.19.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEScan2
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DEScan2
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DEScan2/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEScan2/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档