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DEGseq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DEGseq
从RNA-seq数据识别差异表达基因
Bioconductor版本:版本(3.17)
DEGseq R包从RNA-Seq数据识别差异表达基因。
作者:王Likun < wanglk hsc.pku.edu.cn >和习近平王< wang-xi05 mails.tsinghua.edu.cn >。
维护人员:王Likun < wanglk hsc.pku.edu.cn >
从内部引用(R,回车引用(“DEGseq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DEGseq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DEGseq”)
| R脚本 | DEGseq | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,软件 |
| 版本 | 1.54.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(13.5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.8.0),qvalue、方法 |
| 进口 | 图形、grDevices方法、统计跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
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| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DEGseq_1.54.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DEGseq_1.54.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | DEGseq_1.54.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | DEGseq_1.53.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEGseq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DEGseq |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DEGseq/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DEGseq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
