DAPAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DAPAR

蛋白质丰度差异分析工具与R

Bioconductor版本:发行版(3.16)

软件包DAPAR是Bioconductor的分布式R软件包,它提供了分析无标签蛋白质组学实验定量数据的所有必要功能。与大多数其他类似的R软件包相反,它具有丰富和用户友好的图形界面,因此不需要编程技能(参见“Prostar”软件包)。

作者:Samuel Wieczorek [aut, cre], Florence Combes [aut], Thomas Burger [aut], Vasile-Cosmin Lazar [ctb], Enora Fremy [ctb], Helene Borges [ctb]

维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。Wieczorek at cea.fr>

引用(从R中,输入引用(“DAPAR”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DAPAR")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“DAPAR”)

PDF R脚本 Prostar用户手册
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportMassSpectrometry归一化预处理蛋白质组学质量控制软件
版本 1.30.1
在Bioconductor公司 BioC 3.2 (R-3.2)(7年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.2.0)
进口 BiobaseMSnbaseDAPARdata(>= 1.27.3), utils,highcharterforeach
链接
建议 testthatBiocStyleAnnotationDbiclusterProfilerdiptest集群vioplotvisNetworkvsnigraphFactoMineRfactoextradendextend平行,doParallelMfuzzapclusterforcatsreadxlopenxlsxmultcomppurrr宠物猫knitr规范尺度tidyversecp4pimp4p(> = 1.1),lme4dplyrlimmapreprocessCorestringrtidyr嫁祸于gplotsgrDevices,reshape2,图形,统计,方法,ggplot2RColorBrewer矩阵org.Sc.sgd.db
SystemRequirements
增强了
URL http://www.prostar-proteomics.org/
BugReports https://github.com/prostarproteomics/DAPAR/issues
全靠我
进口我 Prostar
建议我 DAPARdata
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 DAPAR_1.30.1.tar.gz
Windows二进制 DAPAR_1.30.1.zip
macOS二进制文件(x86_64) DAPAR_1.30.1.tgz
macOS二进制文件(arm64) DAPAR_1.29.2.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DAPAR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DAPAR/
软件包下载报告 下载数据
bioc3.16的旧源包 源存档

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网