Bioconductor版本:发行版(3.16)
软件包DAPAR是Bioconductor的分布式R软件包,它提供了分析无标签蛋白质组学实验定量数据的所有必要功能。与大多数其他类似的R软件包相反,它具有丰富和用户友好的图形界面,因此不需要编程技能(参见“Prostar”软件包)。
作者:Samuel Wieczorek [aut, cre], Florence Combes [aut], Thomas Burger [aut], Vasile-Cosmin Lazar [ctb], Enora Fremy [ctb], Helene Borges [ctb]
维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。Wieczorek at cea.fr>
引用(从R中,输入引用(“DAPAR”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DAPAR")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“DAPAR”)
R脚本 | Prostar用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,去,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.30.1 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.2 (R-3.2)(7年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.2.0) |
进口 | Biobase,MSnbase,DAPARdata(>= 1.27.3), utils,highcharter,foreach |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,AnnotationDbi,clusterProfiler,图,diptest,集群,vioplot,visNetwork,vsn,igraph,FactoMineR,factoextra,dendextend平行,doParallel,Mfuzz,apcluster,forcats,readxl,openxlsx,multcomp,purrr,宠物猫,knitr,规范,尺度,tidyverse,cp4p,imp4p(> = 1.1),lme4,dplyr,limma,preprocessCore,stringr,tidyr,嫁祸于,gplotsgrDevices,reshape2,图形,统计,方法,ggplot2,RColorBrewer,矩阵,org.Sc.sgd.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.prostar-proteomics.org/ |
BugReports | https://github.com/prostarproteomics/DAPAR/issues |
全靠我 | |
进口我 | Prostar |
建议我 | DAPARdata |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | DAPAR_1.30.1.tar.gz |
Windows二进制 | DAPAR_1.30.1.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | DAPAR_1.30.1.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | DAPAR_1.29.2.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DAPAR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DAPAR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
bioc3.16的旧源包 | 源存档 |