CytoML

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoML

跨平台细胞检测数据共享的GatingML接口

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用GatingML2.0标准的特定平台实现与其他软件平台交换门控细胞术数据。

作者:迈克·江,杰克·瓦格纳

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.com>

引文(从R内,输入引用(“CytoML”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CytoML”)

超文本标记语言 R脚本 flowJo解析器
超文本标记语言 R脚本 如何导出一个GatingSet到GatingML
超文本标记语言 R脚本 如何将Cytobank导入GatingSet
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometryImmunoOncology软件
版本 2.10.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证 agpl - 3.0
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 cytolib(> = 2.3.10),flowCore(> = 1.99.10),flowWorkspace(> = 4.1.8),openCyto(> = 1.99.2),XMLdata.tablejsonliteRBGLRgraphvizBiobase、方法、,图形,utils,jsonlitedplyr, grDevices,方法,ggcyto(> = 1.11.4),yaml统计数据,宠物猫
链接 cpp11黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLibcytolibRhdf5libflowWorkspace
建议 testthatflowWorkspaceDataknitrrmarkdown、并行
SystemRequirements xml2, GNU make, c++ 11
增强了
URL https://github.com/RGLab/CytoML
BugReports https://github.com/RGLab/CytoML/issues
全靠我
进口我
建议我 FlowSOMflowWorkspaceopenCyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CytoML_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 CytoML_2.9.1.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoML
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/巨细胞
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CytoML/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网