copywriter
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doi：10.18129/b9.bioc.copywriter
使用非目标读取的目标测序中的复制编号信息
生物导体版本：版本（3.15）
撰稿人通过取消靶向启动读数来从目标测序中提取DNA复制编号信息。它允许提取均匀分布的拷贝数信息，无需参考即可使用，并且可以应用于从包括染色质免疫沉淀和小基因面板上的各种技术获得的测序数据。因此，撰稿人构成了广泛适用于可用复制号码检测工具的替代方案。
作者：托马斯·库尔曼
维护者：Oscar Krijgsman
引用（从r内，输入引用（“撰稿人”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ copywriter”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ copywriter”）
| R脚本 | copywriter | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，覆盖范围，，，，Exomeseq，，，，免疫学，，，，预处理，，，，软件，，，，目标征服，，，，可视化 |
| 版本 | 2.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（7年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.2），生物比较 |
| 进口 | 矩阵，，，，gtools，，，，Data.Table，，，，S4VECTORS，，，，chipseq，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，DNACOPIGY，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，CopyHelper，，，，GenomeInfodB，，，，徒劳 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，Sclcbam，，，，雪 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/peeperlab/copywriter |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | copywriter_2.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | COPYWRITER_2.28.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | Coperwriter_2.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/copywriter |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/抄写员 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/copywriter/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
