ChemmineR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChemmineR

化学信息学工具箱

Bioconductor版本:发行版(3.16)

ChemmineR是一个化学信息学软件包，用于分析r中的类药物小分子数据。其最新版本包含了大量分子的高效处理、物理化学/结构性质预测、结构相似性搜索、化合物库的分类和聚类等功能，并使用了广泛的算法。此外，它还提供了化合物聚类结果和化学结构的可视化功能。

作者:Y. Eddie Cao, Kevin Horan, Tyler Backman, Thomas Girke

维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ChemmineR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ChemmineR”)

超文本标记语言	R脚本	ChemmineR
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，CellBasedAssays，Cheminformatics，聚类，DataImport，基础设施，代谢组学，MicrotitrePlateAssay，遗传药理学，药物基因组学，蛋白质组学，软件，可视化
版本	3.50.0
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(14年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10.0)，方法
进口	rjson，图形，统计，RCurl，DBI，消化，BiocGenerics，Rcpp(> = 0.11.0)它,ggplot2、网格gridExtra，png，base64enc，DT，rsvg，jsonlite，stringi
链接	Rcpp，黑洞
建议	RSQLite，scatterplot3d，gplots，fmcsR，雪，RPostgreSQL，BiocStyle，knitr，knitcitations，knitrBootstrap，ChemmineDrugs，png，rmarkdown，BiocManager，助理
SystemRequirements	GNU使
增强了	ChemmineOB
URL	https://github.com/girke-lab/ChemmineR
全靠我	ChemmineDrugs，eiR，fmcsR
进口我	bioassayR，CompoundDb，customCMPdb，eiR，fmcsR，MetID，RMassBank
建议我	ChemmineOB
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChemmineR_3.50.0.tar.gz
Windows二进制	ChemmineR_3.50.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	ChemmineR_3.50.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ChemmineR_3.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChemmineR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChemmineR/
软件包下载报告	下载数据