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别致的
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIC
质量控制管道ChIP-Seq数据
Bioconductor版本:版本(3.17)
质量控制(QC)管道ChIP-seq数据使用一组全面的质量控制指标,包括此前提出的指标以及小说的,基于局部特征的浓缩。包提供函数来计算一组质量控制指标,与参考价值和机器学习纲要样品质量评价模型。
作者:卡门·玛丽亚Livi
维护人员:卡门·玛丽亚Livi <卡门。在external.ifom.eu livi >
从内部引用(R,回车引用(“时髦”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“别致”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“时髦”)
| R脚本 | 别致的 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,质量控制,软件 |
| 版本 | 1.19.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | spp, R (> = 3.6) |
| 进口 | ChIC.data(> = 1.11.1)caTools、方法GenomicRanges,IRanges、并行、进步、randomForest、插入符号grDevices,统计,跑龙套,图形,S4Vectors,BiocGenerics,genomeIntervals,Rsamtools |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
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| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ChIC_1.19.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/别致 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ChIC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
