Bioconductor版本:版本(3.17)
这个包做优化的布尔逻辑网络基于先前的知识网络的信号通路和一组数据在网络中的节点的扰动。
作者:托马斯Cokelaer (aut) Federica Eduati (aut),艾丹业务(aut)年代Schrier[所有],卡米尔Terfve (aut) Enio Gjerga[所有],阿提拉伽柏(cre)
维护人员:<匈奴王阿提拉伽柏。伽柏在uni-heidelberg.de >
从内部引用(R,回车引用(“CellNOptR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CellNOptR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CellNOptR”)
HTML | R脚本 | 布尔逻辑模型的训练信号网络的使用与CellNOptR先验知识网络和扰动数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,ImmunoOncology,网络,通路,蛋白质组学,软件,TimeCourse |
版本 | 1.46.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(11.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.0.0),RBGL,图、方法、RCurlRgraphviz、XML、ggplot2 rmarkdown |
进口 | igraph、stringi stringr |
链接 | |
建议 | 数据。表、dplyr tidyr、readr knitr, RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | Graphviz版本> = 2.2 |
增强了 | doParallel, foreach |
URL | |
取决于我 | CNORdt,CNORfeeder,CNORfuzzy,CNORode |
进口我 | bnem |
建议我 | MEIGOR |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CellNOptR_1.46.0.tar.gz |
Windows二进制 | CellNOptR_1.46.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | CellNOptR_1.46.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | CellNOptR_1.45.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellNOptR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellNOptR |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CellNOptR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CellNOptR/ |
包下载报告 | 下载数据 |