红衣主教

DOI:10.18129 / B9.bioc.Cardinal

统计分析的质谱影像工具箱

Bioconductor版本:版本(3.16)

实现统计和计算工具分析质谱影像数据集,包括有效的预处理方法、空间分割和分类。

作者:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >

维修工:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >

从内部引用(R,回车引用(“红衣主教”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“红衣主教”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“红衣主教”)

HTML R脚本 1。红衣主教2:用户指南进行质谱分析成像分析
HTML R脚本 2。红衣主教3:质谱分析成像的统计方法
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类,聚类,ImagingMassSpectrometry,ImmunoOncology,基础设施,Lipidomics,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,回归,软件
版本 3.0.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 ProtGenerics,BiocGenerics,BiocParallel,EBImage、图形的方法,S4Vectors(> = 0.27.3),统计数据
进口 Biobase,irlba,矩阵,,magrittr,mclust,nlme平行,信号,spstats4跑龙套,viridisLite
链接
建议 BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL http://www.cardinalmsi.org
取决于我 CardinalWorkflows
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Cardinal_3.0.0.tar.gz
Windows二进制 Cardinal_2.15.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) Cardinal_3.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) Cardinal_3.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cardinal
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/红衣主教
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Cardinal/
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