CONSTANd

DOI:10.18129 / B9.bioc.CONSTANd

矩阵耙法数据归一化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

通过耙耙(使用Bacharach的RAS方法，见参考文献)Nrows by Ncols矩阵，使行意味着和列意味着等于1，使数据矩阵“data”正常化。结果是一个规范化的数据矩阵“K=RAS”，它是行乘子“R”和列乘子“S”与原始矩阵“a”的乘积。缺失的信息需要显示为“NA”值，而不是零值，因为CONSTANd能够在计算平均值时忽略缺失的值。使用CONSTANd归一化可以直接比较相同甚至不同CONSTANd归一化数据矩阵内的样本之间的值。

作者:Joris Van Houtven [aut, trl]， Geert Jan Bex [trl]， Dirk Valkenborg [aut, cre]

维护者:Dirk Valkenborg < Dirk。瓦尔肯堡在uhassel .be>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CONSTANd”)

超文本标记语言	R脚本	CONSTANd
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	Cheminformatics，DifferentialExpression，遗传学，MassSpectrometry，归一化，预处理，蛋白质组学，软件，转录组
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，tidyr，ggplot2，gridExtra，魔法，开罗，limma
SystemRequirements
增强了
URL	qcquan.net/constand
BugReports	https://github.com/PDiracDelta/CONSTANd/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CONSTANd_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CONSTANd_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CONSTANd_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CONSTANd_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CONSTANd
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CONSTANd
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CONSTANd/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CONSTANd/
软件包下载报告	下载数据