- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- 狂欢节
狂欢节
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.CARNIVAL
网络识别因果推理工具(从基因表达数据)使用整数值编程
Bioconductor版本:版本(3.16)
升级因果推理工具从R中的米拉等更新作业TFs的重量从后代的分数。可以自由调整优化参数,可以获得多个解决方案和聚合。
作者:Enio Gjerga (aut)
刘,Panuwat Trairatphisan (aut),阿尼卡[所有],阿尔贝托Valdeolivas[所有],尼古拉·佩斯克斯证伪这[所有],Aurelien Dugourd[所有],阿提拉伽柏(cre),奥尔加伊万诺娃(aut)
维护人员:<匈奴王阿提拉伽柏。伽柏在uni-heidelberg.de >
从内部引用(R,回车引用(“狂欢节”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“狂欢节”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“狂欢节”)
| HTML | R脚本 | 中将大规模信号网络与狂欢节表达式的足迹 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,网络,软件,转录组 |
| 版本 | 2.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | readr,stringr,lpSolve,igraph,dplyr,宠物猫,tidyr,rjson,rmarkdown |
| 链接 | |
| 建议 | RefManageR,BiocStyle,covr,knitr,testthat(> = 3.0.0),sessioninfo |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/CARNIVAL |
| BugReports | https://github.com/saezlab/CARNIVAL/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | cosmosR |
| 建议我 | dce |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CARNIVAL_2.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CARNIVAL_2.8.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | CARNIVAL_2.8.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | CARNIVAL_2.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CARNIVAL |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/狂欢节 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CARNIVAL/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CARNIVAL/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
