BumpyMatrix

DOI:10.18129 / B9.bioc.BumpyMatrix

非标量对象的颠簸矩阵

Bioconductor版本:发行版(3.16)

实现BumpyMatrix类和几个子类，用于在矩阵的每个条目中保存非标量对象。这类似于一个粗糙的数组，但粗糙是在第三维度，很像一个凹凸不平的表面-因此得名。特别有趣的是BumpyDataFrameMatrix，其中每个条目都是一个Bioconductor数据帧。这允许我们以一种与二维容器(如summarizeexperiment和MultiAssayExperiment对象)兼容的格式自然地表示多元数据。

作者:Aaron Lun [aut, cre]，基因泰克公司[cph]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BumpyMatrix”)

超文本标记语言	R脚本	BumpyMatrix类
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口	跑龙套、方法矩阵，S4Vectors，IRanges
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/BumpyMatrix
BugReports	https://github.com/LTLA/BumpyMatrix/issues
全靠我
进口我	CoreGx，MerfishData，MouseGastrulationData
建议我	ggspavis，SpatialExperiment，STexampleData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BumpyMatrix_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	BumpyMatrix_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BumpyMatrix_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BumpyMatrix_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BumpyMatrix
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BumpyMatrix
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BumpyMatrix/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BumpyMatrix/
软件包下载报告	下载数据