BiocStyle

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocStyle

小插图和其他Bioconductor文档的标准样式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

提供Bioconductor PDF和HTML文档的标准格式样式。bob彩票平台软件包小插图说明了使用和功能。

作者:Andrzej oleovich，迈克·史密斯[ctb]， Martin Morgan [ctb]， Wolfgang Huber [ctb]， Bioconductor Package [cre]

维护者:Bioconductor Package < Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BiocStyle")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BiocStyle”)

超文本标记语言	R脚本	创作Markdown小插图
PDF	R脚本	生物导体乳胶风格2.0
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.26.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	bookdown，knitr(> = 1.30),rmarkdown(>= 1.2)， stats, utils，yaml，BiocManager
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle/issues
全靠我	curatedBreastData，cytofWorkflow，ExpressionAtlas，methylationArrayAnalysis，netresponse，org.Mxanthus.db，Pigengene，rnaseqGene，RnaSeqGeneEdgeRQL，战，sangeranalyseR
进口我	abseqR，ASpli，bandle，BiocWorkflowTools，BPRMeth，BubbleTree，chimeraviz，指南针，德科，DiscoRhythm，FieldEffectCrc，geneXtendeR，GeoMxWorkflows，梅丽莎，meshr，MSnID，PathoStat，PhyloProfile，PhyloProfileData，锐步，regionReport，Rmmquant，Rqc，scMET，scTensor，scTGIF，simpleSingleCell，srnadiff
建议我	王牌，ADAMgui，ADImpute，AffiXcan，affycoretools，aggregateBioVar，AHEnsDbs，AHLRBaseDbs，AHMeSHDbs，AHPathbankDbs，AHPubMedDbs，AHWikipathwaysDbs，ALDEx2，alevinQC，AllelicImbalance，AlpsNMR，AMOUNTAIN，amplican，AneuFinder，微生物，注释，AnnotationDbi，AnnotationFilter，AnnotationForge，AnnotationHub，AnnotationHubData，annotationTools，annotatr，anota2seq，铁砧，AnVILBilling，AnVILPublish，APAlyzer，APL，arrayQualityMetrics，数组，artMS，ASGSCA，亚瑟士，ASICSdata，AssessORF，AssessORFData，分配，ATACseqQC，ATACseqTFEA，atena，atSNP，AUCell，awst，BaalChIP，培根，bamsignals，强盗，banocc，barcodetrackR，basecallQC，基础知识，蛇怪，basilisk.utils，后面;，bayNorm，baySeq，beachmat，beadarray，BeadDataPackR，BEARscc，BEclear，啤酒，benchdamic，benchmarkfdrData2019，BgeeDB，bigmelon，BindingSiteFinder，bioassayR，Biobase，biobtreeR，bioCancer，BiocBaseUtils，BiocCheck，BiocDockerManager，BiocFileCache，BiocIO，BiocMetaWorkflow，BiocNeighbors，BiocOncoTK，BioCor，BiocParallel，BiocPkgTools，BiocSet，BiocSingular，BiocSklearn，biocthis，biocViews，biodb，biodbChebi，biodbExpasy，biodbHmdb，biodbKegg，biodbLipidmaps，biodbMirbase，biodbNcbi，biodbNci，biodbUniprot，BioImageDbs，biomaRt，biomformat，BioMM，BioNERO，BioPlex，BioPlex，biosigner，biotmle，biscuiteer，BitSeq，blacksheepr，blima，blimaTestingData，BloodCancerMultiOmics2017，咆哮，bnbc，BOBaFIT，bodymapRat，北欧化工，brainflowprobes，BrainSABER，分歧点，breakpointR，breakpointRdata，brendaDb，BRGenomics，BridgeDbR，BrowserViz，bsseq，bugsigdbr，BUMHMM，BumpyMatrix，BUScorrect，BUSpaRse，BUSseq，咖啡馆，CAGEfightR，cageminer，篮球选手，CAGEWorkflow，癌症，CancerInSilico，cardelino，红衣主教，CardinalWorkflows，狂欢节，催化剂，cbaf，CBEA，cBioPortalData，cbpManager，ccfindR，ccImpute，ccrepe，celda，CellaRepertorium，CellBarcode，cellbaseR，CellBench，celldex，CelliD，cellity，CellMapper，CellMapperData，CellMixS，cellTree，cellxgenedp，censcyt，Cepo，CexoR，cfDNAPro，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，芝加哥，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPexoQual，ChIPexoQualExample，ChIPpeakAnno，ChIPQC，chipseqDB，chipseqDBData，ChromSCape，chromstaR，chromswitch，CIMICE，CircSeqAlignTk，CiteFuse，ClassifyR，cleanUpdTSeq，切肉刀，限幅器，cliProfiler，CLLmethylation，clusterExperiment，clusterSeq，ClusterSignificance，clustifyr，clustifyrdatahub，cmapR，cn，CNVMetrics，CNVRanger，可可，CoGAPS，cogeqc，我思，comapr，彗星，coMethDMR，compcodeR，CompoundDb，conclus，承认，consensusOV，consensusSeekeR，consICA，CONSTANd，contiBAIT，conumee，CopyhelpeR，CopyNeutralIMA，CopyNumberPlots，文案，警戒线，CoRegNet，CoreGx，科拉尔，coseq，COSMIC.67，cosmiq，COTAN，covRNA，cpvSNP，crisprBowtie，crisprBwa，crisprDesign，crisprScore，crisprScoreData，CRISPRseek，CrispRVariants，crisprVerse，crisprViz，csaw，csawUsersGuide，csdR，CSSQ，CTCF，CTDquerier，ctgGEM，ctsGE，CTSV，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedMetagenomicData，curatedOvarianData，curatedTBData，curatedTCGAData，customCMPdb，cydar，CyTOFpower，CytoGLMM，cytoKernel，cytomapper，CytoTree，dada2，dagLogo，DAMEfinder，DaMiRseq，DAPAR，dasper，dcanr，dce，ddPCRclust，debCAM，decompTumor2Sig，decontam，deconvR，解耦，反编排，DEGreport，DelayedArray，DelayedMatrixStats，DelayedRandomArray，DelayedTensor，demuxmix，densvis，部，服饰，depmap，DEqMS，derfinder，derfinderData，derfinderHelper，derfinderPlot，DEScan2，DEWSeq，DExMA，DExMAdata，DEXSeq，DIAlignR，DiffBind，diffcyt，DifferentialRegulation，diffuStats，diffUTR，恐龙，dir.expiry，不和谐的，dittoSeq，DmelSGI，DMRScan，dmrseq，DNABarcodeCompatibility，DNABarcodes，DNAfusion，doppelgangR，多萝西娅，Doscheda，定量给料器，drawProteins，DRIMSeq，DropletTestFiles，DropletUtils，drugTargetInteractions，DSS，dStruct，DuoClustering2018，dupRadar，更容易，easierData，easyreporting，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，EGSEA，EGSEA123，eiR，eisaR，埃尔默，ELMER.data，EmpiricalBrownsMethod，emtdata，EnrichmentBrowser，ensembldb，EpiCompare，EpiDISH，epigraHMM，EpiMix，epimutacions，epimutacionsData，epistack，epistasisGA，EpiTxDb，EpiTxDb.Hs.hg38，EpiTxDb.Mm.mm10，EpiTxDb.Sc.sacCer3，epivizr，epivizrChart，epivizrData，epivizrServer，epivizrStandalone，erma，ERSSA，逃避，EuPathDB，evaluomeR，EventPointer，EWCE，ewceData，excluderanges，ExperimentHub，ExperimentHubData，ExperimentSubset，ExploreModelMatrix，ExpressionNormalizationWorkflow，extraChIPs，FamAgg，famat，FastqCleaner，fastreeR，fCCAC，fCI，fcScan，盛宴，小伙子，FilterFFPE，FindIT2，火焰，flowAI，flowcatchR，flowGraph，flowMap，FlowSOM，flowSpecs，fmcsR，fobitools，弗雷泽，furrowSeg，GA4GHclient，GA4GHshiny，空对空导弹，GBScleanR，gcapc，GDSArray，吉玛。R，genbankr，GeneAccord，GeneExpressionSignature，genefilter，genefu，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，geneplast.data，generegulation，《创世纪》，GeneStructureTools，GeneTonic，GenomAutomorphism，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicDataCommons，GenomicDistributions，GenomicDistributionsData，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicInteractionNodes，GenomicInteractions，GenomicRanges，GenomicScores，GenomicState，GenomicSuperSignature，GenomicTuples，GenVisR，GeuvadisTranscriptExpr，ggbio，ggmanh，ggmsa，GGPA，ggspavis，GladiaTOX，Glimma，glmGamPoi，glmSparseNet，gmoviz，GMRP，GOexpress，GOfuncR，还装有，goSorensen，goSTAG，gpart软件，gpuMagic，GRaNIE，制粒机，葡萄，图，石墨，GreyListChIP，GRmetrics，groHMM，GSAR，GSE103322，GSE13015，GSE159526，GSE62944，GSEABase，GSEABenchmarkeR，GSEAmining，GSgalgoR，GSVA，GUIDEseq，Gviz，GWAS。贝叶斯，gwascat，gwasurvivr，GWENA，哈曼，HarmanData，杂环胺，HCAData，HD2013SGI，HDCytoData，healthyControlsPresenceChecker，HelloRanges，HelloRangesDa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包档案

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源包	BiocStyle_2.26.0.tar.gz
Windows二进制	BiocStyle_2.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BiocStyle_2.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BiocStyle_2.25.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BiocStyle
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocStyle
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocStyle/
软件包下载报告	下载数据