BiocParallel

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocParallel

用于并行评估的生物导体设备

Bioconductor版本:Release (3.15)

此包提供了用于并行计算的修改版本和新颖函数实现，为与Bioconductor对象一起使用而定制。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Jiefei Wang [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Michel Lang [aut]， Ryan Thompson [aut]， Nitesh Turaga [aut]， Aaron Lun [ctb]， Henrik Bengtsson [ctb]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocParallel”)

PDF	R脚本	1.BiocParallel简介
PDF	R脚本	2.BatchtoolsParam简介
PDF	R脚本	3.错误，日志和调试
PDF	R脚本	4.BiocParallel中的随机数
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.30.2
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(8.5年)
许可证	Gpl-2 | gpl-3
取决于	方法，R (>= 3.5.0)
进口	属性,跑龙套,futile.logger平行,雪
链接	黑洞
建议	BiocGenerics、工具、foreach，BatchJobs，BBmisc，doParallel，Rmpi，GenomicRanges，RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，VariantAnnotation，Rsamtools，GenomicAlignments，ShortRead，codetools，RUnit，BiocStyle，knitr，batchtools，data.table
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/issues
全靠我	培根，BEclear，红衣主教，ClassifyR，clusterSeq，consensusSeekeR，文案，德科，DEWSeq，DEXSeq，DMCFB，DMCHMM，doppelgangR，DSS，extraChIPs，盛宴，弗雷泽，GenomicFiles，hiReadsProcessor，检查，iPath，事，工商管理硕士，metagene，metagene2，metapone，ncGTW，Oscope，先驱者，PCAN，periodicDNA，pRoloc，Rqc，测序，ShortRead，SigCheck，光谱，STROMA4，SummarizedBenchmark，股东价值分析，variancePartition，xcms
进口我	abseqR，ADImpute，AffiXcan，ALDEx2，AlphaBeta，AlpsNMR，amplican，亚瑟士，ASpediaFI，atena，atSNP，bambu，强盗，bandle，基础知识，后面;，bayNorm，啤酒，benchdamic，BiocNeighbors，BioCor，BiocSingular，BioMM，BioNERO，BioNetStat，biotmle，biscuiteer，咆哮，brendaDb，bsseq，CAGEfightR，篮球选手，CBEA，cellbaseR，CellBench，CelliD，CellMixS，censcyt，Cepo，ChIPexoQual，ChIPQC，ChromSCape，chromswitch，chromVAR，CNVMetrics，CNVRanger，CoGAPS，comapr，coMethDMR，调味品，consensusDE，contiBAIT，CoreGx，coseq，cpvSNP，CrispRVariants，csaw，cydar，CytoGLMM，cytoKernel，cytomapper，dasper，dcGSA，debCAM，DEComplexDisease，DepInfeR，derfinder，DEScan2，DESeq2，DEsingle，DiffBind，恐龙，dmrseq，剂量，DRIMSeq，DropletUtils，沙丘，更容易，easyRNASeq，EMDomics，enhancerHomologSearch，epimutacions，erma，ERSSA，逃避，EWCE，exomePeak2，ExpHunterSuite，fgsea，FindIT2，flowcatchR，flowSpecs，GDCRNATools，《创世纪》，GenoGAM，GenomicAlignments，genotypeeval，gmapR，GRaNIE，gscreend，GSEABenchmarkeR，GSVA，GUIDEseq，h5vc，HiCBricks，HiCcompare，HTSeqGenie，HTSFilter，iasva，icetea，理想的，IHWpaper，ima，imcRtools，感兴趣，电离，首次公开募股，ISAnalytics，iva，KinSwingR，LineagePulse，lisaClust，loci2path，LowMACA，LRcell，Macarron，MACPET，mbkmeans，MCbiclust，MetaboAnnotation，metabomxtr，metaseqR2，MethCP，MethylAid，methylGSA，methylInheritance，methylscaper，MetNet，米娅，miaViz，MIGSA，miloR，minfi，mixOmics，MMAPPR2，MOGAMUN，蒙娜丽莎，motifbreakR，MPRAnalyze，MsBackendMassbank，MsBackendMgf，MsBackendMsp，MsBackendRawFileReader，MSnbase，msqrob2，MSstatsSampleSize，multiHiCcompare，mumosa，马斯喀特，NBAMSeq，NBSplice，nnSVG，NPARC，NxtIRFcore，OmicsLonDA，ORFik，OVESEG，PAIRADISE，PCAtools，PDATK，pengls，PharmacoGx，pipeComp，婴儿车，PrecisionTrialDrawer，高伦雅芙，proFIA，profileplyr，ProteoDisco，PSMatch，qpgraph，qsea，QuasR，RadioGx，Rcwl，重新计票，RegEnrich，REMP，RiboCrypt，RJMCMCNucleosomes，RNAmodR，Rsamtools，RUVcorr，土星，scanMiR，scanMiRApp，嘘，scClassify，scDblFinder，scDD，scde，短链脂肪酸，散粒，scMerge，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，scPCA，食物，scRecover，颈背，scShapes，scTHI，天窗，seqArchR，芝麻，SEtools，sigFeature，signatureSearch，singleCellTK，单，singscore，SNPhood，soGGi，麻雀，spatialHeatmap，SpectralTAD，spicyR，飞溅，SplicingGraphs，srnadiff，sSNAPPY，STdeconvolve，TAPseq，TarSeqQC，TBSignatureProfiler，ternarynet，TFBSTools，TMixClust，ToxicoGx，TPP2D，tradeSeq，TraRe，TreeSummarizedExperiment，时尚的，TSRchitect，TVTB，txcutr，UCell，VariantFiltering，VariantTools，伶盗龙，waddR，weitrix，zinbwave
建议我	beachmat，CAGEWorkflow，DelayedArray，DIAlignR，EpiCompare，GenomicDataCommons，glmGamPoi，HDF5Array，MethylAidData，netSmooth，omicsPrint，PureCN，randRotation，RcisTarget，锐步，scGPS，SeqArray，Single.mTEC.Transcriptomes，TENxBrainData，TENxPBMCData，TFutils，TileDBArray，tofsims，TrajectoryUtils，trena，TSCAN，universalmotif，xcore
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocParallel_1.30.2.tar.gz
Windows二进制	BiocParallel_1.30.2.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocParallel_1.30.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocParallel
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocParallel
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocParallel/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.15的旧源包	源存档