BioNAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioNAR

生物网络分析R

Bioconductor版本:版本(3.17)

R包BioNAR, PPI网络的发达一步一步分析。目标是量化和等级每个蛋白质的同时影响到多个复合物基于网络拓扑和集群。包还支持跨网络评估疾病的多发,特定的集群指向共享/共同机制。

作者:科林•麦克莱恩(aut) Anatoly Sorokin (aut (cre),无人看管Sorokina (aut), j·道格拉斯·阿姆斯特朗(aut,曾经),t .伊恩•辛普森(施,曾经)

维护人员:Anatoly Sorokin < lptolik gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioNAR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	在R BioNAR:生物网络分析
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文本		新闻

细节

biocViews	GraphAndNetwork,网络,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0), igraph (> = 1.4.0) poweRlaw, latex2exp, RSpectra Rdpack
进口	stringr、冬青、synaptome.dbclusterCons,fgsea、网格、方法AnnotationDbidplyr,GO.db,org.Hs.eg.db,WGCNA rSpectral ggplot2、ggrepel minpack。lm、cowplot数据。表、尺度统计数据
链接
建议	knitr、rmarkdown igraphdata testthat (> = 3.0.0), vdiffr, devtools,老鸨,阴谋,randomcoloR
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BioNAR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	BioNAR_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	BioNAR_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	BioNAR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNAR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioNAR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BioNAR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNAR/
包下载报告	下载数据