BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

功能相似

Bioconductor版本:发行版(3.16)

根据KEGG和REACTOME或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以计算路径或基因集、基因或集群,并与其他相似性相结合。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……

作者:Lluís雷维拉·桑丘[aut, cre], Pau Sancho-Bru [ths],胡安José萨尔瓦泰拉·洛萨诺[ths]

维护者:Lluís Revilla Sancho

引文(从R内,输入引用(“BioCor”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BioCor”)

超文本标记语言 R脚本 关于BioCor
超文本标记语言 R脚本 生物ocor的高级用法
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 聚类GeneExpression网络NetworkEnrichment通路软件StatisticalMethodSystemsBiology
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.4.0)
进口 BiocParallelGSEABase矩阵、方法
链接
建议 气道BiocStyle引导DESeq2GOSemSimHmiscknitr(> = 1.35),org.Hs.eg.dbreactome.dbrmarkdown拼写targetscan.Hs.eg.dbtestthatWGCNA
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCorhttps://llrs.github.io/BioCor/
BugReports https://github.com/llrs/BioCor/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BioCor_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 BioCor_1.22.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) BioCor_1.22.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) BioCor_1.21.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioCor
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网