Bioconductor版本:版本(3.17)
BPRMeth包是一个概率的方法来量化明确的甲基化资料的特点,在某种程度上,这将使它更容易在下游正式使用这些资料建模,如预测基因表达水平或集群基因组区域或细胞根据其甲基化配置文件。
作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani (aut (cre)
维护人员:Chantriolnt-Andreas Kapourani < kapouranis。安德烈亚斯在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“BPRMeth”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BPRMeth”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BPRMeth”)
HTML | R脚本 | BPRMeth:模型高阶甲基化的概要文件 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,ImmunoOncology,KEGG,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件 |
版本 | 1.26.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
许可证 | GPL-3 |文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.5.0),GenomicRanges |
进口 | 为了、方法、质量、doParallel平行,e1071,地球,foreach, randomForest,统计数据,IRanges,S4Vectors、数据。表格、图形truncnorm、mvtnorm Rcpp (> = 0.12.14) matrixcalc, magrittr, kernlab, ggplot2, cowplot,BiocStyle |
链接 | Rcpp, RcppArmadillo |
建议 | testthat、knitr rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | 梅丽莎 |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | BPRMeth_1.26.1.tar.gz |
Windows二进制 | BPRMeth_1.26.1.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | BPRMeth_1.26.1.tgz |
macOS二进制(arm64) | BPRMeth_1.25.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BPRMeth |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BPRMeth/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/ |
包下载报告 | 下载数据 |
老BioC 3.17源码包 | 源存档 |