BEclear

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEclear

DNA甲基化数据中批处理效应的修正

Bioconductor版本:发行版(3.16)

提供检测和纠正DNA甲基化数据中的批处理效应的功能。核心函数基于潜在因子模型,也可用于预测任何其他包含实数的矩阵中的缺失值。

作者:大卫·拉斯普, Markus Merl [aut], Ruslan Akulenko [aut]

维护者:David Rasp < David .j。粗声粗气地说:gmail.com >

引用(从R中,输入引用(“BEclear”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" clear")

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“BEclear”)

超文本标记语言 R脚本 BEclear教程
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews BatchEffectDNAMethylation预处理软件StatisticalMethod
版本 2.14.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证 GPL-3
取决于 BiocParallel(> = 1.14.2)
进口 futile.loggerRdpack矩阵data.table(> = 1.11.8),Rcppabind,统计,图形,工具,方法,dixonTestid
链接 Rcpp
建议 testthatBiocStyleknitrrmarkdown老鸨seewave
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL https://github.com/uds-helms/BEclear
BugReports https://github.com/uds-helms/BEclear/issues
取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 BEclear_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 BEclear_2.14.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) BEclear_2.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEclear
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BEclear
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BEclear/
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