AlpsNMR

DOI:10.18129 / B9.bioc.AlpsNMR

核磁共振自动光谱处理系统

Bioconductor版本:发行版(3.16)

读取压缩和解压缩的布鲁克核磁共振数据目录。它为非靶向NMR代谢组学提供自动化和高效的信号处理。它能够插值样本,检测异常值,排除区域,归一化,检测峰值,对齐光谱,整合峰值,管理元数据和可视化光谱。经过光谱处理后,可以对提取的数据进行多元分析。还可以使用1-D数据进行高效绘图。也可提供1D ACD/Labs出口JDX样品的基本读数。

作者:Ivan Montoliu Roura [aut], Sergio Oller Moreno [aut, cre],弗朗西斯科·马德里·甘宾[au],路易斯·费尔南德斯[au],劳拉López Sánchez [ctb], Héctor格拉西亚·卡布雷拉[aut],圣地亚哥·马可Colás [aut], Nestlé卫生科学研究所[cph],加泰罗尼亚生物工程研究所[cph]

维护者:Sergio Oller Moreno

引文(从R内,输入引用(“AlpsNMR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AlpsNMR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AlpsNMR”)

PDF R脚本 AlpsNMR简介(软弃用API)
PDF R脚本 插图01:AlpsNMR介绍(从这里开始)
PDF R脚本 小插图02:处理元数据和注释
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews Cheminformatics分类DataImport代谢组学预处理软件可视化
版本 4.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.2),未来(> = 1.10.0)
进口 跑龙套,泛型,图形,统计,grDevices,magrittr(> = 1.5),dplyr(> = 0.7.5),信号(> = 0.7 6),rlang(> = 0.3.0.1),尺度(> = 1.2.0),stringr(> = 1.3.1),宠物猫(> = 1.3.4),tidyr(> = 1.0.0),tidyselectreadxl(> = 1.1.0版),purrr(> = 0.2.5),胶水(> = 1.2.0),reshape2(> = 3),mixOmics(> =再),matrixStats(> = 0.54.0),fs(> =)相对于1.2.6,rmarkdown(> = 1.10),speaq(> =测试盒框),htmltools(> = 0.3.6),pcaPP-73年(> = 1.9),ggplot2(> = 3.1.0),基线(> = 1.2 1),vctrs(> = 0.3.0),BiocParallel
链接
建议 存档BiocStyleChemoSpeccowplot旋度DT(> = 0.5),GGally(> = 1.4.0),ggrepel(> = 0.8.0),gridExtraknitr情节(> = 4.7.1),progressrSummarizedExperimentS4Vectorstestthat(> = 2.0.0),writexl(> = 1.0),邮政编码(> = 2.0.4)
SystemRequirements
增强了
URL https://sipss.github.io/AlpsNMR/https://github.com/sipss/AlpsNMR
BugReports https://github.com/sipss/AlpsNMR/issues
全靠我
进口我
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链接到我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AlpsNMR_4.0.0.tar.gz
Windows二进制 AlpsNMR_4.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) AlpsNMR_4.0.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) AlpsNMR_3.99.4.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AlpsNMR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AlpsNMR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AlpsNMR/
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