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ASpli
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli
RNA-Seq选择性剪接分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。
作者:埃斯特法尼亚·曼奇尼，安德烈斯·拉宾诺维奇，哈维尔·伊塞尔特，马塞洛·亚诺夫斯基和阿里尔·切尔诺莫雷茨
维护:Estefania Mancini
引文(从R内，输入引用(“ASpli”)):
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ASpli”)
| R脚本 | ASpli | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录 |
| 版本 | 2.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(6年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | 方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机，limma，AnnotationDbi |
| 进口 | GenomicRanges，GenomicFeatures，BiocGenerics，IRanges，GenomicAlignments，Gviz，S4Vectors，Rsamtools，BiocStyle，igraph，htmltools，data.table，UpSetR，tidyr，DT，质量，网格，图形，pbmcapply |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ASpli_2.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ASpli_2.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | ASpli_2.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | ASpli_2.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
