APL

DOI:10.18129 / B9.bioc.APL

协会的情节

Bioconductor版本:发行版(3.16)

APL是一个为计算关联图(AP)而开发的包，AP是一种单细胞转录组数据可视化和分析的方法。APL的主要重点是从输入数据中鉴定单个细胞集群的基因特征。该软件包执行对应分析(CA)，并允许使用关联图识别集群特定的基因。此外，APL计算所有基因的簇特异性得分，这允许根据它们对选定的感兴趣的细胞簇的特异性对基因进行排名。

作者:Elzbieta Gralinska [cre, aut]， Clemens Kohl [aut]， Martin Vingron [aut]

维护者:Elzbieta Gralinska < Gralinska at molgen.mpg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

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超文本标记语言	R脚本	用APL分析数据
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细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，RNASeq，测序，SingleCell，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 4.2)
进口	网状，ggrepel，ggplot2，viridisLite，情节，修拉，SingleCellExperiment，magrittr，SummarizedExperiment，topGO，方法，统计，utils，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，rlang
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，scRNAseq，嘘，食物，testthat
SystemRequirements	Python, pytorch, numpy
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	APL_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	APL_1.1.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	APL_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/APL
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/APL
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/APL/
软件包下载报告	下载数据