AHLRBaseDbs

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHLRBaseDbs

LRBaseDbs for AnnotationHub

Bioconductor版本:发行版(3.16)

为许多物种提供“LRbaseDb”配体-受体注释数据库。所有的SQLite文件都是由我们的Snakemake工作流[lrbase-workflow](https://github.com/rikenbit/lrbase-workflow)生成的。具体请参见README。lrbase-workflow的Md。

作者:Tsuyuzaki Koki [aut, cre], Manabu Ishii [aut], Itoshi Nikaido [aut]

维护人员:Koki Tsuyuzaki

引文(从R内,输入引用(“AHLRBaseDbs”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AHLRBaseDbs”)

超文本标记语言 R脚本 为AnnotationHub提供LRBaseDb数据库
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AnnotationDataAnnotationHubFunctionalAnnotationLRBaseDb
版本 1.5.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1.0)
进口 AnnotationHub(> = 2.22.0)
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/rikenbit/AHLRBaseDbs/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AHLRBaseDbs_1.5.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AHLRBaseDbs/
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