举起

doi:10.18129/b9.bioc.liftover

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅举起

用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover

生物导体版本:3.9

与UCSC浏览器轨道基础架构共同开发的升力设施可用于以Granges格式转换数据。此处用EBI/NHGRI GWAS目录的图像进行了说明,该图像截至2017年5月10日,它与NCBI Build HG38定义的坐标分发。

作者:生物导体软件包维护器[AUT,CRE]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“举重”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ liftover”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“举重”)

html R脚本 用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover

细节

生物浏览 BasicWorkFlow,,,,工作流程
版本 1.8.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),Gwascat,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,同性恋,,,,生物基因
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/liftover/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 liftover_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/liftover
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/举升
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/liftover/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网