该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅举起。
生物导体版本:3.9
与UCSC浏览器轨道基础架构共同开发的升力设施可用于以Granges格式转换数据。此处用EBI/NHGRI GWAS目录的图像进行了说明,该图像截至2017年5月10日,它与NCBI Build HG38定义的坐标分发。
作者:生物导体软件包维护器[AUT,CRE]
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“举重”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ liftover”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“举重”)
html | R脚本 | 用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover |
生物浏览 | BasicWorkFlow,,,,工作流程 |
版本 | 1.8.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3.0),Gwascat,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,同性恋,,,,生物基因 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/liftover/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | liftover_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/liftover |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/举升 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/liftover/ |
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