scRNAseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.scRNAseq

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scRNAseq。

公共单细胞RNA-Seq数据集的集合

Bioconductor版本:3.9

能够阅读项三个公共scRNA-seq数据集。有关详细信息,请参阅装饰图案。

作者:大卫Risso (aut、cre cph),迈克尔·科尔(aut)

维护人员:大卫Risso < Risso。大卫。gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scRNAseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scRNAseq”)

HTML	R脚本	scRNAseq
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData
版本	1.10.0
许可证	CC0
取决于	R (> = 3.3),SummarizedExperiment
进口
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	后面;,clusterExperiment,iSEE,scFeatureFilter,司康饼,simpleSingleCell,SingleCellExperiment,singleCellTK,SummarizedBenchmark,zinbwave
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scRNAseq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRNAseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scRNAseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scRNAseq/
包下载报告	下载数据