这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见ccTutorial.
Bioconductor版本:3.9
这是一个包含ChIP-chip教程的数据包,该教程已发表在《公共科学图书馆计算生物学》上。这个包中的数据和源代码允许读者完全重现教程中的步骤。
作者:Joern Toedling, Wolfgang Huber
维护者:Joern Toedling < Joern。在curie.fr>蹒跚
引文(从R内,输入引用(“ccTutorial”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ccTutorial")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ccTutorial”)
R脚本 | 关于如何使用Bioconductor分析ChIP-chip读出的教程 | |
R脚本 | 关于如何使用Bioconductor分析ChIP-chip读出的教程的补充 | |
参考手册 |
biocViews | ChipOnChipData,ExperimentData,MicroarrayData,Mus_musculus_Data |
版本 | 1.22.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),林格(> = 1.9.8),affy(> = 1.23.4),topGO(> = 1.13.1) |
进口 | Biobase |
链接 | |
建议 | biomaRt,Biobase(> = 2.5.5),xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ccTutorial_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccTutorial |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ccTutorial |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ccTutorial/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |