rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14
doi：10.18129/b9.bioc.rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14。
RNASEQ实验的对齐读数：通过HNRNPC敲低和控制HeLa细胞的高通量测序进行转录分析
生物导体版本：3.9
该软件包包含8个BAM文件，每次测序运行1个。每个BAM文件是通过（1）将读取（配对端）与TopHat2的完整HG19基因组对齐的，然后（2）子集将读取（配对端）对齐以保持CHR14的比对。有关该实验的详细信息，请参见ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147，包括指向已发表研究的链接（Zarnack等，2012）和FastQ文件。
作者：HervéPagès
维护者：fredhutch.org上的hervépagès
引用（从r内，输入引用（“ rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | ArrayExpress，，，，实验数据，，，，地理，，，，基因组，，，，homo_sapiens_data，，，，NCI，，，，rnaseqdata，，，，序列数据 |
| 版本 | 0.22.0 |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 基因组签名，，，，生物管理器 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/e-mtab-1147/ |
| 取决于我 | samexplorer，，，，测序 |
| 进口我 | |
| 建议我 | 生物比较，，，，基因组签名，，，，Genomicfiles，，，，基因组机，，，，怒吼，，，，rsamtools，，，，剪接图 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14_0.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
