此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本,请参阅hmp16sdata.。
生物导体版本:3.9
HMP16SDATA是可变区1-3和3-5的人微生物族项目(HMP)16S RRNA测序数据的生物导音器实验。从HMP数据分析和协调中心下载的包中提供了原始数据文件。经过实验室,处理数据作为摘要提供类对象。
作者:lucas schiffer
维护者:Lucas Schiffer
引文(从R内,输入引文(“HMP16SDATA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:
if(!percenamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“hmp16sdata”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“HMP16SDATA”)
HTML. | r script. | hmp16sdata. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 实验室那实验室那homo_sapiens_data.那microbiomedata.那sorfucibleresearch.那semencingdata. |
版本 | 1.4.1 |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 3.6.0),概括分析 |
进口 | annotationhub.那assertthat.那dplyr.那实验室那kableextra那kn那Magrittr., 方法,读书那S4Vectors.那娇媚,实用程序 |
链接到 | |
建议 | BioBase.那bioccheck.那Biocmanager.那生物焦那盘旋那Covr.那电台那腌制胶癌那dendextend.那devtools.那ggplot2.那格拉底那避风港那文学那RAMAMAMDOW.那Roxygen2.,统计,testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/waldronlab/hmp16sdata. |
Bugreports. | https://github.com/waldronlab/hmp16sdata/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | hmp16sdata_1.4.1.tar.gz. |
Windows二进制文件 | |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/hmp16sdata. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocumon.org:包/ hmp16sdata |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/hmp16sdata/ |
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