这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见FlowSorted.CordBloodCombined.450k.
Bioconductor版本:3.9
原始数据对象用于脐带血细胞比例估计在minfi和类似的包。FlowSorted.CordBloodCombined。450k对象基于Bakulski等人、Gervin等人、de Goede等人和Lin等人分析的样本。
作者:Lucas A. Salas [cre, aut], Kristina Gervin [aut], Meaghan C. Jones [aut], Kelly M. Bakulski [ctb], Devin C. Koestler [ctb], John K. Wiencke [ctb], Karl T. Kelsey [ctb], Robert Lyle [ctb], Brock C. Christensen [ctb], Janine Felix [ctb]
维护者:Lucas A. Salas < Lucas .a.salas。Diaz,达特茅斯。edu>
引文(从R内,输入引用(“FlowSorted.CordBloodCombined.450k”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" flowsored . cordbloodcombination .450k")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“FlowSorted.CordBloodCombined.450k”)
超文本标记语言 | R脚本 | FlowSorted.CordBloodCombined.450k |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,基因组,Homo_sapiens_Data,MethylationArrayData,MicroarrayData,组织,TissueMicroarrayData |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6),minfi(> = 1.21.2),SummarizedExperiment,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19(> = 0.2.1),IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19,ExperimentHub(> = 1.9.1),FlowSorted.Blood.EPIC,跑龙套 |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat,IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.CordBloodCombined.450k |
BugReports | https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.CordBloodCombined.450k/issues。 |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | FlowSorted.CordBloodCombined.450k_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSorted.CordBloodCombined.450k |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FlowSorted.CordBloodCombined.450k |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FlowSorted.CordBloodCombined.450k/ |
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