targetscan.Mm.eg.db

DOI:10.18129 / B9.bioc.targetscan.Mm.eg.db

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅targetscan.Mm.eg.db。

对鼠标TargetScan microrna的目标预测

Bioconductor版本:3.9

TargetScan microrna的目标预测鼠标从TargetScan组装使用数据的网站。TargetScan预测生物microrna的目标通过搜索保存8 mer的存在和7 mer网站每个microrna的种子区域相匹配。种子地区还发现了网站有不匹配所补偿的守恒的3 '配对。在哺乳动物中,预测排名预测疗效的基础上针对使用上下文计算分数的网站。

作者:伽柏Csardi <伽柏。在unil.ch Csardi >

维护人员:詹姆斯·f·里德<詹姆斯。里德在ifom-ieo-campus.it >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“targetscan.Mm.eg.db”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData,FunctionalAnnotation
版本	0.6.1
许可证	文件许可
取决于	R(> = 2.7.0)、方法AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口	方法,AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	MmPalateMiRNA
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	targetscan.Mm.eg.db_0.6.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/targetscan.Mm.eg.db/
包下载报告	下载数据