该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅txdb.hsapiens.ucsc.hg19。
生物导体版本:3.9
通过将其公开为TXDB对象,暴露了从UCSC生成的注释数据库
作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),bioconductor.org> [cre]的生物导体套件维护器<维护器
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nown)”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,TXDB |
版本 | 3.2.2 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | GenomicFeatures(> = 1.21.30) |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 注解,,,,嵌合体,,,,FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,funcisnp,,,,同性恋,,,,变体,,,,瓦肯 |
进口我 | 感谢,,,,chipqc,,,,Chipseeker,,,,Demptumor2sig,,,,profileplyr,,,,Rarevariantvis,,,,RCGH |
建议我 | 等位基因平衡,,,,AnnotationDbi,,,,Annotatr,,,,atacseqqc,,,,Beadarray,,,,Bioconcotk,,,,生物比较,,,,Biomvrcns,,,,Biovizbase,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Bumphunter,,,,CGDV17,,,,chipenrich.data,,,,Chippeakanno,,,,Chromplot,,,,CPVSNP,,,,CRISPRSEEK,,,,德芬德,,,,derfinderplot,,,,esatac,,,,ga4ghclient,,,,ga4ghshiny,,,,量规,,,,基因贡献,,,,创世纪,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomicsCores,,,,Genvisr,,,,GGBIO,,,,GMAPR,,,,gqtlstats,,,,grohmm,,,,Guideseq,,,,htseqgenie,,,,inpas,,,,核粒子,,,,桅杆,,,,甲基分析,,,,突变模式,,,,校长,,,,属属,,,,R3CPET,,,,地区报告,,,,肋骨蛋白,,,,rtracklayer,,,,sgseq,,,,sigfuge,,,,剪接图,,,,总结性特征,,,,tcgautils,,,,tfea.chip,,,,TrackViewer,,,,transcriptr,,,,tximport,,,,变体,,,,变体滤波器 |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene_3.2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene/ |
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