snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37

doi：10.18129/b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37。

HOMO SAPIENS的SNP位置（DBSNP构建144）

生物导体版本：3.9

从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因144.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2015年5月29日至30日创建的，并包含用于参考Genome Grch37.p13的SNP。警告：请注意，GRCH37.P13基因组是GRCH37的修补版本。但是，补丁不会改变染色体1-22，x，y，mt。GRCH37本身与来自UCSC *的HG19基因组相同，但对于线粒体染色体除外。因此，该软件包中的SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中，它们将降落在正确的位置，但该注入将排除CHRM（即，该序列中不会注入任何内容）。

作者：HervéPagès

维护者：fredhutch.org上的H.pagès

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	AnnotationData，，，，遗传学，，，，homo_sapiens，，，，snplocs
版本	0.99.20
执照	艺术2.0
要看	BSGENOME（> = 1.43.4）
进口	方法，utils，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，BSGENOME
链接
建议	生物弦，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我	eqtl
进口我	感谢
建议我	等位基因平衡，，，，GenomicsCores，，，，ggtools，，，，mafdb.1kgenomes.phase1.hs37d5，，，，mafdb.1kgenomes.phase3.hs37d5，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137.hs37d5，，，，mafdb.exac.r1.0.hs37d5，，，，mafdb.exac.r1.0.nontcga.hs37d5，，，，mafdb.gnomad.r2.1.hs37d5，，，，mafdb.gnomadex.r2.1.hs37d5，，，，mafdb.topmed.freeze5.hg19，，，，变体滤波器，，，，xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37
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包装档案

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源包	snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11（El Capitan）
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37/
软件包下载报告	下载统计