SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

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这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38．

智人的SNP位点(dbSNP Build 141)

Bioconductor版本:3.9

NCBI dbSNP Build 141中智人的SNP位点和等位基因用于此包的源数据文件由NCBI于2014年5月1日创建，包含映射到参考基因组GRCh38的snp。注意，这些snp可以被“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或bsgenome . hspiens . ucsc .hg38。重要提示:此包已弃用。请使用基于最新dbSNP BUILD的SNPlocs数据包(例如BUILD 144或BUILD 149)。你可以从R中调用BSgenome::available. snps()来获得可用的SNPlocs数据包列表。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，SNPlocs
版本	0.99.11
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome(> = 1.33.9)
进口	方法,跑龙套,S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	genotypeeval，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38_0.99.11.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38/
软件包下载报告	下载数据