SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109．

智人的SNP位点(dbSNP Build 132)

Bioconductor版本:3.9

NCBI dbSNP Build 132中智人的SNP位点和等位基因用于此包的源数据文件由NCBI于2010年11月9日创建，包含映射到参考基因组GRCh37的snp。警告:请注意，除了线粒体染色体外，GRCh37基因组与UCSC的hg19基因组相同。因此，该包中的snp可以被“注入”到bsgenome . hspiens . ucsc中。hg19，但此注射将排除chrM(即不会以该序列注射任何东西)。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens
版本	0.99.7
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，IRanges，GenomicRanges
进口	方法,S4Vectors，IRanges，GenomicRanges
链接
建议	Biostrings，BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	ceu1kg，VariantAnnotation
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.7.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109/
软件包下载报告	下载数据