这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5.
Bioconductor版本:3.9
存储1000个基因组计划第一阶段的小等位基因频率数据,用于人类基因组版本hs37d5。
作者:Robert Castelo [aut, cre]
维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>
引文(从R内,输入引用(“MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" mafdb . 1kgenome .phase1.hs37d5")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,GenomicScores,Homo_sapiens |
版本 | 3.7.1 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.0.0),GenomicScores(> = 1.3.19) |
进口 | 跑龙套,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,GenomeInfoDb,BSgenome |
链接 | |
建议 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | GenomicScores,VariantFiltering |
链接到我 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5_3.7.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |