bsgenome.sscrofa.ucsc.susscr3.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.sscrofa.ucsc.susscr3.masked

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.sscrofa.ucsc.susscr3.masked

SUS SCROFA的完整蒙版基因组序列(UCSC版本SUSSCR3)

生物导体版本:3.9

UCSC(SUSSCR3,2011年8月)提供的SUS SCROFA(PIG)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.sscrofa.ucsc.susscr3中的序列相同,除了每个序列在顶部都有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)内部内部的掩模。歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

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生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,SUS_SCROFA
版本 1.3.99
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