该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10。
生物导体版本:3.9
UCSC(MM10,2011年12月)提供的Mus Musculus(小鼠)的完整基因组序列,并存储在生物弦物体中。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,mus_musculus |
版本 | 1.4.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.33.5) |
进口 | BSGENOME |
链接 | |
建议 | txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked,,,,doqtl |
进口我 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked,,,,GenStructurotootools,,,,特雷娜 |
建议我 | Aneufinder,,,,BSGENOME,,,,GCAPC,,,,基因组机,,,,inpas,,,,幻影,,,,NADFINDER,,,,RCAS,,,,Scmeth |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10/ |
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