bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19

Homo Sapiens的完整基因组序列(UCSC版本HG19)

生物导体版本:3.9

UCSC(HG19,2009年2月)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.hsapiens.hsapiens.ucsc.hg19”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,homo_sapiens
版本 1.4.0
执照 艺术2.0
要看 BSGENOME(> = 1.33.5)
进口 BSGENOME
链接
建议 txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我 注解,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,嵌合体,,,,法典,,,,主题,,,,测序,,,,Traser,,,,变体
进口我 感谢,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,芯片,,,,Demptumor2sig,,,,Madseq,,,,Rarevariantvis,,,,RCAS,,,,tcgaworkflow,,,,特雷娜
建议我 Aneufinder,,,,arraytv,,,,atacseqqc,,,,不良区域,,,,basic4cseq,,,,BBCANALYZER,,,,Biovizbase,,,,Chippeakanno,,,,Chromvar,,,,CNER,,,,CRISPRSEEK,,,,CustomProdb,,,,dnashaper,,,,esatac,,,,fdb.fantom4.promoters.hg19,,,,fdb.ucsc.snp135common.hg19,,,,fdb.ucsc.snp137common.hg19,,,,GCAPC,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomicsCores,,,,Genvisr,,,,GGBIO,,,,GMAPR,,,,Guideseq,,,,GVIZ,,,,H5VC,,,,inpas,,,,兴趣,,,,同工型间分析仪,,,,核粒子,,,,Medips,,,,最小值,,,,幻影,,,,Motifbreakr,,,,MotifMatchr,,,,突变模式,,,,ORFIK,,,,有机体,,,,PGA,,,,plyranges,,,,QSEA,,,,R453plus1toolbox,,,,稀有,,,,REMP,,,,rgadem,,,,肋骨蛋白,,,,rsamtools,,,,RSVSIM,,,,rtracklayer,,,,sgseq,,,,签名者,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,结构视频隔离,,,,变体,,,,Wavcluster,,,,xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,yapsa
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网