AHEnsDbs

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHEnsDbs

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见AHEnsDbs．

用于AnnotationHub的EnsDbs

Bioconductor版本:3.9

为AnnotationHub提供所有物种的基于EnsDb ensemble的注释数据库。EnsDb SQLite数据库是通过使用Ensembl Perl API的ensembldb包中的函数从Ensembl MySQL数据库中单独生成的。

作者:约翰内斯·雷纳

维护者:Johannes Rainer < Johannes。Rainer在eurac。edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AHEnsDbs")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AHEnsDbs”)

超文本标记语言	R脚本	为AnnotationHub提供EnsDb数据库
PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，报道，DataImport，测序
版本	1.0.9
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4)，方法，ensembldb(> = 1.99.10)
进口	AnnotationHubData(> = 1.5.24)
链接
建议	BiocStyle，knitr，AnnotationHub(> = 2.7.13)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AHEnsDbs_1.0.9.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AHEnsDbs/
软件包下载报告	下载数据