Universalmotif
doi：10.18129/b9.bioc.universalmotif
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅Universalmotif。
用R导入，修改和导出图案
生物导体版本：3.9
允许将大多数常见的基序类型导入R，以通过其他生物导体相关软件包提供的功能使用。可以将基序导出为来自其他生物导体包装定义的各种类别的大多数主要基序格式。包括一个基序和序列操纵和分析函数的套件，包括富集，比较，p值计算，改组，修剪，高阶基序等。
作者：本杰明·让·玛丽·特雷伯（Benjamin Jean-Marie Tremblay）[AUT，CRE]
维护者：本杰明·让·玛丽·特雷伯（Benjamin Jean-Marie Tremblay）
引用（从r内，输入引用（“ Universalmotif”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ UniversalMotif”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Universalmotif”）
| R脚本 | 高级用法：主题和序列分析 | |
| R脚本 | “ Universalmotif”简介 | |
| R脚本 | 序列主题简介 | |
| R脚本 | 图案进口，出口和操纵 | |
| R脚本 | 序列操纵和扫描 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，结肠管制，，，，图案，，，，主题，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 方法，统计，utils，GGPLOT2，，，，猿，，，，格特里，，，，ggseqlogo，，，，gtools，，，，RCPP，，，，rdpack（> = 0.7），生物弦，，，，生物基因，，，，processx，，，，S4VECTORS，，，，Yaml |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 拼写，，，，尼特，，，，生物使用，，，，TFBSTOOLS，，，，rmarkDown，，，，主题，，，，测试，，，，logolas，，，，生物比较，，，，seqlogo，，，，Motifstack |
| 系统要求 | |
| 增强 | 动机，，，，pwmenrich，，，，rgadem，，，，主题 |
| URL | https://github.com/bjmt/universalmotif |
| BugReports | https://github.com/bjmt/universalmotif/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Universalmotif_1.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | Universalmotif_1.2.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Universalmotif_1.2.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/universalmotif |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/universalmotif |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/universalmotif/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
