triform

DOI:10.18129 / B9.bioc.triform

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见triform．

Triform在转录因子ChIP-sequencing数据中发现富集区域(峰)

Bioconductor版本:3.9

Triform算法使用无模型统计数据来识别TF ChIP测序reads的类峰分布，利用改进的峰值定义结合已知的剖面特征。

作者:Karl Kornacker(开发者)，Tony Handstad(开发者)

维护者:Thomas Carroll

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("triform")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“triform”)

PDF	R脚本	Triform用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，测序，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.11.0)，IRanges，yaml
进口	BiocGenerics，IRanges(> = 2.5.27),yaml
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	triform_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	triform_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	triform_1.26.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triform
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/triform
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/triform/
软件包下载报告	下载数据