tracktables

DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见tracktables．

构建IGV跟踪和HTML报告

Bioconductor版本:3.9

在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。

作者:Tom Carroll, Sanjay Khadayate, Anne Pajon, Ziwei Liang

维护人员:Tom Carroll

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tracktables")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“tracktables”)

PDF	R脚本	创建带有跟踪表的IGV HTML报告
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ReportWriting，测序，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor公司	bio 3.0 (R-3.1)(5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.0.0)
进口	IRanges，GenomicRanges，XVector，Rsamtools，XML，tractor.base，stringr，RColorBrewer、方法
链接
建议	knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	tracktables_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	tracktables_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	tracktables_1.18.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tracktables
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
软件包下载报告	下载数据