该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅TrackViewer。
生物导体版本:3.9
可视化映射的读取与注释作为NGS数据集的轨道层,例如芯片seq,rna-seq,miRNA-seq,dna-seq,SNP和甲基化数据。
作者:Jianhong OU和Lihua Julie Zhu
维护者:jianhong ou
引用(从r内,输入引用(“ TrackViewer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ trackViewer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ TrackViewer”)
html | R脚本 | TrackViewer Vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 软件,,,,可视化 |
版本 | 1.20.5 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(5。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.1.0),grdevices,方法,基因组机, 网格 |
进口 | GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,GVIZ,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS,,,,rtracklayer,,,,生物基因,,,,秤, 工具,iranges,,,,AnnotationDbi,,,,格里姆波特,,,,htmlwidgets,,,,plotrix,,,,rgraphviz,,,,互动集,,,,图形,UTILS |
链接 | |
建议 | Biomart,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,运行,,,,org.hs.eg.db,,,,生物使用,,,,尼特,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | NADFINDER |
建议我 | atacseqqc,,,,Chippeakanno |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | TrackViewer_1.20.5.5.tar.gz |
Windows二进制 | TrackViewer_1.20.5.5.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | TrackViewer_1.20.5.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackviewer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/trackViewer |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/trackviewer/ |
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