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DOI：10.18129 / b9.bioc.topgo

此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本，请参阅顶点。

基因本体学的富集分析

生物导体版本：3.9

Topgo套件提供用于测试GO条款的工具，同时考虑GO图形的拓扑。可以实现和应用不同的测试统计信息和用于消除GO项之间的局部相似之处和依赖性的不同方法。

作者：Adrian Alexa，Jorg Rahnenfuhrer

维护者：Adrian Alexa

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“topgo”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“TOPGO”）

PDF.	r script.	顶点
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	微阵列那软件那可视化
版本	2.36.0
在生物导体中以来	BIOC 2.0（R-2.5）（12.5岁）
执照	LGPL.
依靠	R（> = 2.10.0），方法，生物根系（> = 0.13.6），图形（> = 1.14.0），BioBase.（> = 2.0.0），go.db.（> = 2.3.0），annotationdbi.（> = 1.7.19），斯特勒姆（> = 0.73）
进口	格子那MatrixStats.那DBI.
链接到
建议	全部那hgu95av2.db.那hgu133a.db.那Genefilter.那xtable.那Multtest.那rghrachviz那全球化境
系统要求
加强
URL.
取决于我	BGEedB.那CcTutorial.那细胞那COMPETOOLS.那EGSEA.那理想的那牧师那RCA.那rnaity那翻译
进口我	纤维学那enrichmentbrowser.那折零那GOSIM那omadb.那pcaexplorer.那psygenet2r.那Sepa.那转录图表
建议我	FGNet.那intramirexplorer.那Mirnatap.那林诺
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	topgo_2.36.0.tar.gz.
Windows二进制文件	topgo_2.36.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	topgo_2.36.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/topgo.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ Topgo
包短网址	https://biocumon.org/packages/topgo//
包裹下载报告	下载统计信息