此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tRNAscanImport.
Bioconductor版本:3.9
该包将tRNAscan-SE的结果作为GRanges对象导入。
作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]
维护人员:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上说
引用(从R中,输入引用(“tRNAscanImport”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“tRNAscanImport”)
超文本标记语言 | R脚本 | tRNAscanImport |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,预处理,软件,可视化,WorkflowStep |
版本 | 1.4.2 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.5),GenomicRanges,tRNA |
进口 | 方法,自信的,stringr,BiocGenerics,Biostrings,Structstrings,S4Vectors,GenomeInfoDb,rtracklayer |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | Structstrings,tRNA |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | tRNAscanImport_1.4.2.tar.gz |
Windows二进制 | tRNAscanImport_1.4.2.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | tRNAscanImport_1.4.2.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tRNAscanImport |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/ |
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