这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见tRNA.
Bioconductor版本:3.9
tRNA包允许访问tRNA序列和结构,并用于子集设置。此外,它还提供了可视化工具来比较多个tRNA集的特征参数,并将它们与其他数据关联起来。tRNA包使用GRanges对象作为输入,只需要少量额外的列数据集。
作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]
维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道
引文(从R内,输入引用(“tRNA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tRNA")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tRNA”)
超文本标记语言 | R脚本 | tRNA |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 软件,可视化 |
版本 | 1.2.2 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(1年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.5),GenomicRanges,Structstrings |
进口 | stringr,S4Vectors、方法、自信的,BiocGenerics,IRanges,XVector,Biostrings,Modstrings,ggplot2,尺度 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,tRNAscanImport |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/FelixErnst/tRNA/issues |
全靠我 | tRNAdbImport,tRNAscanImport |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | tRNA_1.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | tRNA_1.2.2.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | tRNA_1.2.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tRNA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tRNA/ |
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