switchde

DOI:10.18129 / B9.bioc.switchde

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见switchde．

跨越单细胞轨迹的开关样差异表达

Bioconductor版本:3.9

跨单细胞RNA-seq轨迹的开关样差异表达的推断和检测。

作者:Kieran Campbell [aut, cre]

维护者:Kieran Campbell

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("switchde")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“switchde”)

超文本标记语言	R脚本	交换机包概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，回归，SingleCell，软件，转录组
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4)，SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment，dplyr，ggplot2、方法、统计
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，numDeriv，tidyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kieranrcampbell/switchde
BugReports	https://github.com/kieranrcampbell/switchde
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	switchde_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	switchde_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	switchde_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/switchde
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/switchde
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/switchde/
软件包下载报告	下载数据