spliceSites

DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceSites

这个包是Bioconductor的3.9版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅spliceSites。

bioconductor包的探索从RNA-seq数据对齐间隙位置

Bioconductor版本:3.9

执行拼接RNA-seq集中分析数据。

作者:沃尔夫冈·凯瑟

维护者:沃尔夫冈·凯瑟在med.uni-duesseldorf.de > <凯撒

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spliceSites”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“spliceSites”)

PDF	R脚本	spliceSites
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,蛋白质组学,RNAseq,软件
版本	1.31.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,rbamtools (> = 2.14.3),refGenome(> = 1.6.0),Biobase,Biostrings(> = 2.28.0)
进口	BiocGenerics,杜比环绕声系统,seqLogo,IRanges
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	spliceSites_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	spliceSites_1.31.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	spliceSites_1.31.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spliceSites
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spliceSites/
包下载报告	下载数据