Snpstats.

DOI：10.18129 / b9.bioc.snpstats.

此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Snpstats.。

snpmatrix和xsnpmatrix类和方法

生物导体版本：3.9

大型SNP协会研究的课程与统计方法。这扩展了先前的SNPMATrix包，允许基因型中的不确定性。

作者：David Clayton

维护者：David Clayton

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“snpstats”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“SNPSTATS”）

PDF.	r script.	数据输入
PDF.	r script.	FST.
PDF.	r script.	归纳和荟萃分析
PDF.	r script.	LD统计学
PDF.	r script.	主要成分分析
PDF.		snpmatrix差异
PDF.	r script.	snpstats介绍
PDF.	r script.	TDT测试
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	遗传性那微阵列那SNP.那软件
版本	1.34.0
在生物导体中以来	BIOC 2.8（R-2.13）（8.5岁）
执照	GPL-3.
依靠	r（> = 2.10.0），生存那矩阵， 方法
进口	图形，grdevices，stats，utils，生物根系那Zlibbioc
链接到
建议	六己
系统要求
加强
URL.
取决于我	EQTL.那GGBase.那ggdata.
进口我	funcisnp.那GenegeneInter那GGTools.那gqtlstats.那ldblock.那马蒂尼鸡尾酒那RVS.那得分invhap.
建议我	CRLMM.那Gwascat那Gwastools.那omicrexposome.那omicsprint.那VariantAnnotation.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	snpstats_1.34.0.tar.gz.
Windows二进制文件	snpstats_1.34.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	snpstats_1.33.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/snpstats.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ snpstats
包短网址	https://biocumon.org/packages/snpstats/
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